Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00518Q8N0U6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00518Q8N0U6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms