Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE1Q8N0S2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms