Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP3Q8IZU3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms