Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOT2Q8IXI1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms