Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLF2Q8IX21 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms