Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ5

TRIM42, Tripartite motif-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM42Q8IWZ5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM42Q8IWZ5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms