Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC117Q8IWD4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC117Q8IWD4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms