Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDKL3Q8IVW4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms