Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGDCC3Q8IVU1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms