Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUZ0

LRRC49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC49Q8IUZ0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC49Q8IUZ0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC49Q8IUZ0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC49Q8IUZ0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC49Q8IUZ0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC49Q8IUZ0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC49Q8IUZ0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC49Q8IUZ0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC49Q8IUZ0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC49Q8IUZ0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC49Q8IUZ0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC49Q8IUZ0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC49Q8IUZ0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC49Q8IUZ0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC49Q8IUZ0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC49Q8IUZ0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC49Q8IUZ0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC49Q8IUZ0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC49Q8IUZ0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC49Q8IUZ0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC49Q8IUZ0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC49Q8IUZ0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC49Q8IUZ0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms