Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
VPS37DQ86XT2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
VPS37DQ86XT2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms