Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPAINQ86UA6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPAINQ86UA6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
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