Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms