Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms