Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CHST3Q7LGC8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHST3Q7LGC8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms