Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 781.5 ms