Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms