Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R3FQ6ZSY5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R3FQ6ZSY5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R3FQ6ZSY5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PPP1R3FQ6ZSY5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PPP1R3FQ6ZSY5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPP1R3FQ6ZSY5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPP1R3FQ6ZSY5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPP1R3FQ6ZSY5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1043.4 ms