Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNA4

RNF111, E3 ubiquitin-protein ligase Arkadia, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF111Q6ZNA4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF111Q6ZNA4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms