Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PACS1Q6VY07 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms