Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMC5Q6UXY8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMC5Q6UXY8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMC5Q6UXY8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMC5Q6UXY8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMC5Q6UXY8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMC5Q6UXY8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMC5Q6UXY8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC5Q6UXY8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC5Q6UXY8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms