Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF7

NXPE4, NXPE family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE4Q6UWF7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NXPE4Q6UWF7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms