Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC171Q6TFL3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms