Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SAMD1Q6SPF0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms