Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUI8

C19orf48, Uncharacterized protein C19orf48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf48Q6RUI8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C19orf48Q6RUI8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms