Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BLOC1S2Q6QNY1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BLOC1S2Q6QNY1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BLOC1S2Q6QNY1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BLOC1S2Q6QNY1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BLOC1S2Q6QNY1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BLOC1S2Q6QNY1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BLOC1S2Q6QNY1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BLOC1S2Q6QNY1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BLOC1S2Q6QNY1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BLOC1S2Q6QNY1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BLOC1S2Q6QNY1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BLOC1S2Q6QNY1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms