Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RFWD3Q6PCD5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RFWD3Q6PCD5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms