Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A2

GALNT18, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT18Q6P9A2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GALNT18Q6P9A2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GALNT18Q6P9A2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GALNT18Q6P9A2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GALNT18Q6P9A2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GALNT18Q6P9A2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GALNT18Q6P9A2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GALNT18Q6P9A2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GALNT18Q6P9A2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GALNT18Q6P9A2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GALNT18Q6P9A2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GALNT18Q6P9A2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GALNT18Q6P9A2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GALNT18Q6P9A2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GALNT18Q6P9A2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GALNT18Q6P9A2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms