Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC42EP5Q6NZY7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDC42EP5Q6NZY7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms