Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP3Q6NUK4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms