Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMBOX1Q6NT76 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HMBOX1Q6NT76 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms