Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF6Q6KF10 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms