Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ22

RAB12, Ras-related protein Rab-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12Q6IQ22 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB12Q6IQ22 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB12Q6IQ22 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB12Q6IQ22 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB12Q6IQ22 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB12Q6IQ22 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB12Q6IQ22 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB12Q6IQ22 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB12Q6IQ22 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RAB12Q6IQ22 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RAB12Q6IQ22 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB12Q6IQ22 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms