Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC19Q6DKK2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms