Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCTD16Q68DU8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
KCTD16Q68DU8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
KCTD16Q68DU8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCTD16Q68DU8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCTD16Q68DU8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCTD16Q68DU8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCTD16Q68DU8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCTD16Q68DU8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCTD16Q68DU8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCTD16Q68DU8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCTD16Q68DU8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCTD16Q68DU8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCTD16Q68DU8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms