Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG87

PAPD7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD7Q5XG87 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAPD7Q5XG87 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms