Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYM1

C9orf131, Uncharacterized protein C9orf131, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf131Q5VYM1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C9orf131Q5VYM1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C9orf131Q5VYM1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C9orf131Q5VYM1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C9orf131Q5VYM1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C9orf131Q5VYM1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C9orf131Q5VYM1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C9orf131Q5VYM1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C9orf131Q5VYM1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C9orf131Q5VYM1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
C9orf131Q5VYM1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C9orf131Q5VYM1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C9orf131Q5VYM1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
C9orf131Q5VYM1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
C9orf131Q5VYM1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C9orf131Q5VYM1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C9orf131Q5VYM1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf131Q5VYM1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf131Q5VYM1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms