Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD1Q5VV17 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD1Q5VV17 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms