Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf135Q5VTT2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms