Protein–RNA interactions for Protein: Q5TB30

DEPDC1, DEP domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1Q5TB30 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DEPDC1Q5TB30 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms