Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM78Q5T7P6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms