Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5Y3

CAMSAP1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP1Q5T5Y3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CAMSAP1Q5T5Y3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CAMSAP1Q5T5Y3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CAMSAP1Q5T5Y3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CAMSAP1Q5T5Y3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CAMSAP1Q5T5Y3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CAMSAP1Q5T5Y3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CAMSAP1Q5T5Y3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CAMSAP1Q5T5Y3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CAMSAP1Q5T5Y3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CAMSAP1Q5T5Y3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CAMSAP1Q5T5Y3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CAMSAP1Q5T5Y3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CAMSAP1Q5T5Y3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CAMSAP1Q5T5Y3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CAMSAP1Q5T5Y3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CAMSAP1Q5T5Y3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CAMSAP1Q5T5Y3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CAMSAP1Q5T5Y3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms