Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5M9

CCNJ, Cyclin-J, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJQ5T5M9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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