Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAPPC3LQ5T215 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAPPC3LQ5T215 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC3LQ5T215 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms