Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZD1

C6orf141, Uncharacterized protein C6orf141, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf141Q5SZD1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C6orf141Q5SZD1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C6orf141Q5SZD1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C6orf141Q5SZD1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C6orf141Q5SZD1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C6orf141Q5SZD1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C6orf141Q5SZD1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C6orf141Q5SZD1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C6orf141Q5SZD1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
C6orf141Q5SZD1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C6orf141Q5SZD1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C6orf141Q5SZD1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C6orf141Q5SZD1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C6orf141Q5SZD1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C6orf141Q5SZD1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C6orf141Q5SZD1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C6orf141Q5SZD1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C6orf141Q5SZD1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C6orf141Q5SZD1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C6orf141Q5SZD1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21■□□□□ 0.95
C6orf141Q5SZD1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C6orf141Q5SZD1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C6orf141Q5SZD1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C6orf141Q5SZD1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C6orf141Q5SZD1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C6orf141Q5SZD1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C6orf141Q5SZD1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C6orf141Q5SZD1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C6orf141Q5SZD1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C6orf141Q5SZD1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms