Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms