Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HP1BP3Q5SSJ5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms