Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMD4BQ5PRF9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms