Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO47Q5MNV8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO47Q5MNV8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO47Q5MNV8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO47Q5MNV8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO47Q5MNV8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO47Q5MNV8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO47Q5MNV8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO47Q5MNV8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO47Q5MNV8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO47Q5MNV8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO47Q5MNV8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO47Q5MNV8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO47Q5MNV8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO47Q5MNV8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO47Q5MNV8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO47Q5MNV8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO47Q5MNV8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO47Q5MNV8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms