Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX7

PLEKHG4, Puratrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHG4Q58EX7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PLEKHG4Q58EX7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLEKHG4Q58EX7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLEKHG4Q58EX7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PLEKHG4Q58EX7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLEKHG4Q58EX7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLEKHG4Q58EX7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLEKHG4Q58EX7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLEKHG4Q58EX7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLEKHG4Q58EX7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLEKHG4Q58EX7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLEKHG4Q58EX7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLEKHG4Q58EX7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLEKHG4Q58EX7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLEKHG4Q58EX7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLEKHG4Q58EX7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLEKHG4Q58EX7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PLEKHG4Q58EX7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLEKHG4Q58EX7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLEKHG4Q58EX7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLEKHG4Q58EX7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms